Speaker: 张稷晨，中国科学院上海高等研究院

Title: SMRT测序中基于动力学信号建模的DNA甲基化检测

Language: Chinese

Time & Venue: 2026.07.28 14:00-15:00 思源楼S817

Abstract: PacBio单分子实时测序（SMRT）是DNA测序的常用方法，它能够记录DNA合成过程中的聚合酶动力学信号，为直接检测DNA甲基化提供了可能。然而，部分甲基化类型引起的信号变化较弱，并受到局部序列环境，甲基化基序等因素影响，给准确识别带来困难。

本报告将介绍一种基于动力学信号建模的DNA甲基化检测方法。该方法首先从未甲基化样本中学习不同序列环境下的预期动力学信号，再将其与实际观测信号和序列信息结合，用于识别甲基化引起的信号偏离。实验结果表明，该方法能够改善多种原核生物甲基化类型的检测，并在不同物种、基序和测序平台之间表现出一定的泛化能力。